Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms