Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms