Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Col4a3Q9QZS0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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