Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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