Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Crlf1Q9JM58 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Crlf1Q9JM58 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Crlf1Q9JM58 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Crlf1Q9JM58 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Crlf1Q9JM58 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Crlf1Q9JM58 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Crlf1Q9JM58 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Crlf1Q9JM58 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Crlf1Q9JM58 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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