Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms