Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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