Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ptp4a3Q9D658 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms