Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms