Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Exo5Q9CXP9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms