Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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Usp11Q99K46 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Usp11Q99K46 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp11Q99K46 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp11Q99K46 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp11Q99K46 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp11Q99K46 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp11Q99K46 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp11Q99K46 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms