Protein–RNA interactions for Protein: Q99J64

Rbm43, RNA-binding protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm43Q99J64 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm43Q99J64 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms