Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms