Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms