Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trim68Q8K243 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trim68Q8K243 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trim68Q8K243 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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