Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Card11Q8CIS0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms