Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc3Q8CFZ4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1652.6 ms