Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Hpf1Q8CFE2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Hpf1Q8CFE2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hpf1Q8CFE2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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