Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms