Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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