Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp20Q8C6M1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms