Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms