Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3cQ80U95 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms