Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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