Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Rph3alQ768S4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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Rph3alQ768S4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Rph3alQ768S4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Rph3alQ768S4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Rph3alQ768S4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Rph3alQ768S4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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Rph3alQ768S4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rph3alQ768S4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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