Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim28Q62318 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Trim28Q62318 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Trim28Q62318 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim28Q62318 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms