Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga6Q61739 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms