Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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