Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epha1Q60750 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epha1Q60750 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms