Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggnbp2Q5SV77 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms