Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim58Q5NCC9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms