Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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