Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms