Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rtl6Q505G4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rtl6Q505G4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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