Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trp53i11Q4QQM4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trp53i11Q4QQM4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trp53i11Q4QQM4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trp53i11Q4QQM4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trp53i11Q4QQM4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trp53i11Q4QQM4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trp53i11Q4QQM4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trp53i11Q4QQM4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trp53i11Q4QQM4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trp53i11Q4QQM4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trp53i11Q4QQM4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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