Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29609Q3UU56 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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