Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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