Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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