Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc174Q3U155 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc174Q3U155 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms