Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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