Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms