Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
MestQ07646 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
MestQ07646 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MestQ07646 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms