Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snai1Q02085 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snai1Q02085 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snai1Q02085 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snai1Q02085 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snai1Q02085 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snai1Q02085 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snai1Q02085 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snai1Q02085 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snai1Q02085 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snai1Q02085 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms