Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms