Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps11P62281 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps11P62281 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Rps11P62281 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms