Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Lmo4P61969 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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