Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P58686 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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