Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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