Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FmodP50608 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FmodP50608 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms