Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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